Tem como linha mestra realizar pesquisas científicas e tecnológicas que auxiliem na compreensão do meio ambiente e dos efeitos da ação humana sobre ele, assim como desenvolver processos tecnológicos que visem minimizar ou mitigar desequilíbrios de ecossistemas. Os projetos, considerando aspectos abióticos e bióticos, envolvem monitoramento da qualidade das águas, controle da poluição provocada pelas indústrias regionais e diversas ações para identificação genética de espécies animais e vegetais, com vistas a repovoamento e desenvolvimento sustentável.